通常入力に変更をして入力を進めても問題ありません。

当年の住民税が［6月分］と［7月分以降］の2種類の場合は、［通常入力］に変更後、金額を入力してください。
このとき、［詳細入力］の1回目に入力されている金額が［通常入力］の1～5回目にコピーされます。

すでに入力済みの2～5回目の給与明細には反映されませんので問題ありません。