出勤時間の自動計算するかどうかは、「給与体系」－「体系基本情報の登録」を起動し、該当社員が所属する給与体系を選択してから、［その他の設定］タブの中の［出勤時間自動計算］にて設定ができます。
「社員情報の登録」の［給与区分］が［時給］の社員は、自動計算を行いませんので、手入力してください。

【参考】
自動計算される出勤時間は、「前準備」－「支給日の登録」で入力した［要勤務時間］に給与入力で入力した［出勤日数］を乗じた時間です。