ダウンロードした申告書のzipファイルを解凍する際に、UTF-8に対応していない解凍ソフト（Lhaplusや+Lhaca等）を利用していることが原因の可能性があります。
UTF-8に対応している解凍ソフトを利用するか、申告書のzipファイルを右クリックして「すべて展開」を実行してください。