「ファイル」－「データの保守」にて変更できます。
詳細は下記の資料のp10～「［参考資料］倉庫別在庫管理を始める方法」をご確認ください。

【注意】
・倉庫別在庫管理を［しない］から［する］に変更する場合は、倉庫別の在庫マスターを手作業で登録する必要があるため、期首に行うことをお勧めします。
・必ず、事前にデータのバックアップを取ってから行ってください。表示されない場合はこちら（PDF）をご確認ください。