受注残と発注残を同時に消込することはできません。
「売上・仕入伝票入力」では受注伝票、「仕入・売上伝票入力」では発注伝票としか連動できないためです。
同時に消込したい場合は、売上・仕入同時入力ではなく、売上伝票入力/仕入伝票入力それぞれで
受注伝票/発注伝票から連動入力して消込をする必要があります。