「受注・発注伝票入力」画面の［設定］－［入力項目の設定］にて、［発注単価］を［標準原価］にし、［発注単価を原価にコピーする］にチェックをいれてください。

発注単価の代入設定を［標準原価］にすることで、見積伝票から連動入力した場合発注単価に見積伝票の原価が代入されます。
この状態で［発注単価を原価にコピーする］にチェックをいれることで、原価も見積伝票の原価が反映されます。