「貯蔵品の除却」にて、除却処理が可能です。

「資産」―「資産の登録」にて、該当する資産の詳細画面に進みます。

[除却・売却]タブに「貯蔵品の除却」欄がありますので、「貯蔵品除却年月」等を入力してください。