年末調整計算が実行されていない可能性があります。
［年末調整］が［しない］になっていることを確認し、「年末調整」－「年末調整計算」にて該当社員を指定し［計算］ボタンをクリックします。
法定調書合計表の確認や電子申告用データの作り直しを行ってください。
【参考】
年末調整計算後に法定調書合計表で退職者が含まれていない場合は、［読込］ボタンをクリックし、最後に［登録］ボタンをクリックします。
［読込］ボタンがグレーでクリックできない場合は、「法定調書合計表」内の入力箇所（入力できる箇所であればどこでも可）をクリックしてください。