「月額変更（算定基礎）届」「賞与支払届」で［電子申請用集計］を行うと、「データが不正です」と表示され作成できないのは、電子媒体データ作成に必要な情報で未入力の項目があるためです。

該当の帳票を起動し、出力の種類を［画面］に、帳票の選択を［電子申請チェックリスト］に変更して画面出力すると、不足している項目を確認できます。
エラーの項目にカーソルと合わせると内容が表示されますので、修正後、［電子申請用集計］を行ってください。