電子取引のファイルを保存する際には必要ありません。
スキャナ保存のファイルを保存する際は、伝票とファイルの紐付けをすることで「スキャン文書と帳簿との相互関係保持」の要件を満たすことができますが、他の方法(スキャンした文書に管理用の伝票番号を付し、帳簿に記載される内容と関連付けを行うなど)でもこの要件を満たすことはできますので、必ずしも必要はありません。
なお、PCAソフトの伝票とファイルを紐づける方法は
こちらをご覧ください。
また、『PCA会計シリーズ』の「クイック処理」で作成した伝票についても、自動的に紐づけが行われます。