「バーコードラベルの設計」で登録時に「現在の商品コード桁数では、出力できません。よろしいですか?」とメッセージが出ます。

バーコードの種類が[JAN][ITF]の場合、対象のコード桁数に制限があるため、設定内容によってこちらのメッセージが出ます。
[JAN]…商品コード桁数は8桁または13桁
※バーコード印刷時にチェックデジットを付加して印刷できます。
・チェックデジットを付加するにチェックを付けた場合は、
商品コード桁数は7桁または12桁でも構いません。
・チェックデジットを付加するにチェックを付けない場合は、
商品コード桁数を8桁または13桁で設定し、
8桁目/13桁目はお客様自身でチェックデジットを入れておく必要があります。
[ITF]…商品コード桁数は偶数桁
バーコードの[項目設定]画面を開き、選択している[出力対象]が正しいかと、
[バーコードの種類]等の選択肢が正しいかをご確認ください。
【例】
・バーコードで[出力対象]を[商品コード2]とする予定が、[商品コード]になっている。
・[バーコードの種類]を[CODE39]にする予定が、[JAN]になっている。

【参考】
各バーコードの種類の説明は、[ヘルプ]ボタンからご確認いただけます。