支払先を設定する前に仕入伝票を入力していたことが考えられます。

支払先を設定していない状態で仕入伝票を入力した後、「仕入先の登録」で支払先を設定しても入力済みの仕入伝票には反映されません。
仕入伝票には伝票入力時の「仕入先の登録」にて設定されている情報を保持しているためです。

既に入力している仕入伝票に支払先の情報を反映させるためには、仕入伝票の［仕入先コード］を打ち直していただく必要があります。

詳細は下記の資料をご確認ください。表示されない場合はこちら（PDF）をご確認ください。