「仕入先の登録」で［支払先コード］をつけると、買掛金・未払金元帳や支払伝票などの残高に関する処理が参照できなくなります。
支払先の設定をした後に伝票を入力していない場合は、元の設定に戻すこともできますが、その際は「仕入先の登録」の［支払］タブ内の設定がクリアされてしまうため、再設定が必要です。

【参考】
今まで使っていた仕入先（子）に支払先コード（親）を設定するのではなく、新規で「子どもとなる仕入先」を登録して、そちらに支払先を設定することをお勧めします。
詳細は下記の資料をご確認ください。表示されない場合はこちら（PDF）をご確認ください。