注文書の印刷設定で自社名が「印字しない」になっているか、フリーフォーマットの帳票を使用している可能性があります。

【手順】
伝票入力画面から印刷する場合は、「仕入管理」－「発注」－「個別発注伝票入力」の画面左上［ファイル］－［注文書の発行方法］を開き、一括発行の場合は、「仕入管理」－「発注」－「注文書の一括発行」を開くと、出力項目のチェックボックスに［自社名欄］という項目がありますので、ここにチェックを入れてください。
また、ここがグレーアウトしている場合は、フリーフォーマットの帳票を使用しています。
この場合は、使用する注文書のフリーフォーマットにて自社名を直接入力してください。

【注意】
「フリーフォーマット」はシステムA・じまん（jiman）ではご使用になれません。