仕入先マスターの消費税計算欄が［免税］もしくは［しない（手入力）］になっているか、
以前［免税］・［しない（手入力）］に設定していたものを途中で変更していることが考えられます。
消費税が計算されない仕入伝票で仕入先を一度別の仕入先にしてから、再度正しい仕入先に直して伝票を再登録してください。
【参考】
仕入伝票の入力後に仕入先マスターの変更を行っても、自動的に伝票には反映されません。
既存の伝票上で仕入先を読込み直すことにより、現在の仕入先の設定で消費税を再計算します。

 

詳細は下記の資料をご確認ください。表示されない場合はこちら（PDF）をご確認ください。