決算書に[株主資本等変動計算書]や[注記表]がないのですが。
合算領域であることが考えられます。
『PCA会計シリーズ(システムA、じまん、jimanを除く)』では複数の領域を合算して、合計残高試算表や決算書を作成する合算処理という機能が搭載されています。
合算処理では合算用のデータ領域を作成しますが、合算用のデータ領域では[株主資本等変動計算書]や[注記表]が表示されません。
[株主資本等変動計算書]や[注記表]は合算用の領域ではなく、元の領域で出力してください。
合算処理についてはこちら(FAQ)をご確認ください。
【通常の領域で決算書を出力】
【合算領域で決算書を出力】

【参考】
合算領域の会社名には、先頭に[*(アスタリスク)]が付きます。
会社名を変更したため確認ができない場合は、「随時」-「FR形式XBRL出力」を起動してください。
合算領域の場合は、以下のメッセージが表示されます。