以下の原因が考えられます。
 

【今回の申告が「中間申告」の場合】
［還付申告に関する明細書］は、確定申告の場合に出力されます。
そのため、今回の申告が中間申告の場合は、［還付申告に関する明細書］は出力されません。
なお、申告が確定申告かどうかは「消費税申告書・付表」の［申告書項目］－［金額等１］タブの［申告区分］にて確認、変更ができます。 

【中間納付額の影響でマイナスになっている場合】
中間申告で納付した金額が大きい場合、確定申告で［㉖消費税及び地方消費税の合計（納付又は還付）税額］がマイナスになることがあります。
［還付申告に関する明細書］は、中間納付税額が反映される前の［⑧控除不足還付税額］に金額がある場合に出力されます。
  

なお、中間納付税額は「消費税申告書・付表」の［申告書項目］－［金額等２］タブの［中間納付税額］［中間納付譲渡割額］に入力します。
  

【参考】
国税庁のホームページ「タックスアンサー（よくある税の質問）」－「消費税」－「申告と納税」－「No.6615 確定申告書等に添付することとなる書類」