「資産」－「資産の登録」を起動し、該当の資産をダブルクリックして詳細画面を開きます。
［基本(2)］タブの［当期償却限度額］もしくは［当期償却額］をクリックして、

［F3］キーもしくは［上書き］ボタンをクリックします。

入力欄が青色に変わり、金額を変更できるようになります。

【参考】
償却費の内訳（配賦）を変更したい場合は、「配賦情報の登録」にて行います。