【参考】
［内税額を自動計算する］にチェックを付けるとき、汎用データ内の［消費税額］は0や空欄でも問題ありません。また、［内税額を自動計算する］にチェックを付けると、受け入れる汎用データ内に［消費税額］が設定されていても、その金額は使用せずに自動計算を行います。

【注意】
消費税額等の端数処理は「一の適格請求書につき、税率毎に1回の端数処理（新消令70の10、インボイス通達３－12）」とされていますが、受け入れる仕訳からは「一の適格請求書単位」の区別ができないため、［内税額を自動計算する］を使用すると仕訳行ごとの消費税端数処理を行います。
受け入れる仕訳が「一の適格請求書単位、税率毎」でない場合は、［内税額を自動計算する］を使用せず、作成する汎用データに［消費税額］を入力した上で受入を行ってください。